清康熙三十年（公元1691年），康熙在多伦淖尔（今多伦）附近会见内外蒙古各部、旗王公、台吉——史称“多伦会盟”，并应蒙古封建王公所请，答应“愿建寺以彰盛典”，开始修建寺院，翌年开始修建汇宗寺。
虽几经损毁，1945年又毁于战火，但索幸其主体区域还是大致保留了下来，在2003年又重新进行了修复。如今，作为国保的汇宗寺免费向游客开放。