东吴、东晋、宋、齐、梁、陈合称“六朝”。南京因此得名“六朝古都”。
隋灭陈后，隋文帝下诏建康城内所有宫苑城池，全部夷为平地，改作耕田。
南京此后被压制多年，直到明太祖朱元璋在此建都称帝，重新开始了大规模的城市建设。
六朝时期地面遗迹几乎无所寻觅，只有地下出土的文物，为后人讲诉这段历史。