上海市历史博物馆藏品总数约11万件，藏品来源主要来自上级部门调拨（上海市文物管理委员会）、系统内其他单位移交（上海博物馆等），另有市场征集、参与拍卖、接受捐赠所得。藏品类别分十五大类：书画、金属、陶瓷、工艺、证章、文献、印刷、纺织品、石刻、钱币、照片、剪纸、邮票、唱片和其他杂项等。