五塔寺原名慈灯寺，位于呼和浩特旧城东南，五塔只是慈灯寺内的一座佛塔。曾经寺院建筑全都坍塌只剩下这座佛塔，因此才有后人得知此处有寺院，重建时便名为五塔寺。五塔寺是一座藏传佛教寺院，也是蒙古地区藏传佛教的发源地。
五塔寺的南面面对五塔寺广场，入口也在此处。五塔寺布局是典型的汉族的中轴线特色，中轴线南北走向，两边严格对称。寺内共分为三个院落，分别是南边的三世佛殿院，中间的文化展院和北边的慈灯寺院。五塔寺的面积不大，纵深仅有150米左右。