孜珠山也有代表六道轮回的绕山道，前来朝圣转经的苯教信徒虔诚的不远千里来此朝拜。苯教信徒与佛教信徒有着明显的不同之处：他们转经沿着逆时针方向而不是顺时针方向，诵经的不是六字真言，而是苯教的八字真言。这条艰险的转寺绕山路径风景绝佳。
由于地处4800米的雪山上，修行条件自然很艰苦，寺庙为这里的僧人们开办了内明、辩论、禅定3所学校，僧人在孜珠寺从内明开始修学到禅定，要学习苯教187部显宗、密宗及大圆满经典。
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