2005年8月2日，江苏省第一座城市博物馆——南通城市博物馆在该市建成并部分对外开放。南通被誉为“中国博物馆之城”，南通城市博物馆的建成，给在此召开的全国文博事业发展一百周年庆典送上贺礼。
南通市城市博物馆是市规划管理局实施的市政府重点工程，由两院院士、著名的规划大师吴良镛先生及建筑大师何玉如先生主持设计。展馆濒临濠河，地处南大街商业中心，与国内第一座公共博物馆——南通博物苑隔河相望。