建宁闽江源自然保护区武夷山脉中亚热带森林生态系统保护区的重要组成部分，是珍稀野生动植物的良好栖息地，有国家重点保护植物36种，国家级保护动物17种。建立闽江源省级自然保护区，对于闽江水源涵养以及生物多样性的保护都具有重要义。