明孝陵博物馆位于孝陵正式入口“大金门”之外，整个园区以前属于南京某个工厂，现在全部整修成历史园区。孝陵博物馆里保存着一些不适合露天保存的孝陵建筑构件，还有模拟的地宫景象，有针对小朋友的动手区以及很不错的纪念品商店。