弥陀寺始建于唐代，是蓬莱阁景区内唯一的佛教寺庙。明万历十一年（1583年），佛教名僧憨山德清（明末四大禅僧之一）来山东崂山传教，含辛茹苦十二年，终于实现了他儒、释、道三教合一、各宗并进、禅净双修的思想。由于当时代表了佛教革新的先进思想，在崂山以及胶东地区的佛教界影响很深，他的弟子遍布各地。这时，蓬莱阁内的弥陀寺香火复盛，渐渐扩建成今天的规模。弥陀是号称西方三圣之一的阿弥陀佛的简称（西方三圣指的是阿弥陀佛、观世音、大势至）。弥陀寺是供奉阿弥陀佛的寺庙。