東長寺是空海（弘法大师）自唐归国后滞留福冈期间修建的密教寺院。当时寺址在吴服町，后因战乱荒废，后由福岡藩二代藩主黒田忠之复兴，迁移到现在的寺址。黒田忠之身后亦葬于此，東長寺因之成为黒田家除崇福寺外另一处菩提寺。