相传藏传佛教格鲁派创始人宗喀巴大师诞生之时，母亲番萨阿切在铰断脐带时，滴了三滴血，后来此地便长出一株菩提树。后来宗喀巴大师移居西藏，其母亲常常想念儿子，宗喀巴大师便修书一封，告诉其母在菩提树旁修建一座佛塔，见塔如见人。后人为护塔护树，又修建了一座大金瓦殿。这既是塔尔寺先有塔后有寺的缘由，也是该树主干包于银塔内的缘由。 如今，众多黄教信徒仍不惜长途跋涉，来此朝拜，以示虔诚。