黄旗海自然保护区处于乌兰察布市，隶属于察右前旗的白海子镇、玫瑰营镇、巴音塔拉镇、土贵乌拉镇和乌拉哈乡，总面积36823公顷。保护区内主要保护对象为黄旗海周边滩涂湿地生态系统，以及在此湿地栖息的珍稀鸟类和各种生物。黄旗海自然保护区内的内陆湖泊——“黄旗海”是内蒙古西部三大内陆湖泊之一，是内蒙古西部湿地生物多样性较为丰富的区域之一，是湿地鸟类迁徙的重要集散地。