这是介绍绳文文化的博物馆，位于函馆北部的南茅部区。绳文时代是日本由旧石器时代进入新石器时代，约一万年以前到公元前一世纪前后的时期。馆内展出了3500多年前制造的石器、陶器、配饰等绳文遗迹，其中1975年在农作时出土的中空土偶（一种空心黏土人像，昵称“茅空”）被指定为日本重要文化财，并且是北海道的国宝。馆内体验学习室有陶器、绳文编、土笛、首饰制作等7种项目。