北海道大学博物馆位于北海道大学的札幌校区，是在1999年由校园中部的旧理学馆大楼改建而来的，收藏着世界上众多较为珍贵的标本和学术资料，展示了从明治时代至今世界范围内的水域中所采集的大型鱼类标本等。博物馆的一楼是学术展，展厅中设有“北海道大学历史”、“学术主题”、“学术资料”等展览，二楼是资料库，三楼藏有千万年前的恐龙和一些昆虫的标本以及化石和矿物等。值得一提的是，这里还展示了较前沿的学术成果，此外还有面向青少年的科普展。