2001年，由于兴建珠江隧道需要，小蓬仙馆启动保护性迁建。迁建后的小蓬仙馆位于在荔湾区芳村醉观公园内。现仅存前殿和两边侧房，但仍可窥其建筑水平之高。前殿正面石额“小蓬仙馆”为80厘米丁方隶书，苍劲有力，两座侧门的门楣上方书有“清镜”和“平砥”字样。前殿山墙檐下一排烘托，上有“花开富贵”图，均为砖刻，线条清晰，刻工精细。檐下一块长约10米、宽40厘米的长幅木刻浮雕，雕有花果蔬菜图案20余组，极富地方特色，是不可多得的木刻艺术品。