古籍文献展厅陈列了卷帙浩繁的藏医药文献中具有代表性的1000多函典籍，还展出了300多部现当代藏医药学书籍和珍贵的古籍印版。通过古籍印板，《四部医典》、《月王药诊》、《祖先口述》、《四部医典蓝琉璃》、《晶珠本草》等典籍，显示了作为世界四大传统医学之一的藏医药学浩瀚的典籍和博大精深、体系完整的藏医药学理论。数百部现当代藏医药学书籍展示了古老的藏医药学理论研究后继有人，从中我们会看到，藏医药学理论研究又迎来了一个百花齐放、推陈出新的新时代。