凤山国家地质公园博物馆位于广西凤山县城东的穿龙岩内，占地面积约4.15万平方米，空间高度达100米，底部常年有潺潺的流水趟过，是我国目前利用天然洞穴建设的空间最大、钟乳石展品最多、格局最美、展示最奇特的地质博物馆；馆内设了图文灯箱展区、实物展区、科普演示及游客服务区、沙盘模型展区、凤山旅游商品及水景区共五个展区，在布展风格上把洞穴原生态和现代展览技术各种元素有机结合，突出色彩、灯光与洞穴的和谐；在布展内容上除原址遗留的地质遗存物，还收集了凤山国家地质公园其他景区以及全国各地的典型地质遗迹标本，是休闲旅游、科普教育的好地方。目前正在进行工程改造，已闭馆，期待早日完工重新对外开放。

位于中国第五大洞穴厅堂凤山县穿龙岩内的凤山国家地质公园博物馆，占地4200平方米，空间高度达100米，具有特殊地质科学意义、稀有性、美学价值和教育功能的重要地质遗产，才能入选“世界地质公园”。2010年10月3日，在希腊举行的世界地质公园新成员评审会上，中国凤山地质公园和乐业大石围天坑群地质公园联袂成功入选世界地质公园，成为广西第一个世界地质公园旅游景区。