三元宫是云台山区的主庙，是花果山的主体建筑，为天下名山寺院。三元宫易名海宁禅寺，早年供有三元圣像，现改塑释迦牟尼佛。抗战时期，三元宫庞大庙宇群化为一片瓦砾。近年经过多次修葺，已逐渐全面恢复原貌，只在东南部位的下方，保留下一块当年的残垣断壁，作为历史的见证。三元宫的主要建筑——大雄宝殿，面前有两棵千年银杏，显示着三元宫古老的历史。抗日战争时三元宫遭受日寇飞机的狂轰滥炸，这两棵树虽然枝干断裂遍体枯焦，但在胜利的春风吹拂下，又绽发新芽，结出了累累果实。三元宫是花果山半山上一组宛如宫阙的建筑群，发迹于唐，重建于宋，敕建和扩建于明，兴盛于清，山门和“敕赐护国三元宫”门额，都是明代遗物。三元宫的主建筑是三元殿，祀奉三元大帝。