泉州佛教博物馆建筑面积三千七百多平方米，建有殿、堂、房、舍几十间，均系木面结构，殿宇五重，中间三进采用蜡角式建筑，其中戒坛为重檐，五重正殿依次排列，在正对山门的一条中轴线上，与东西两厢的钟、石雕廊房建筑相连接，浑然一体，布局严谨，气象庄严，朴实壮观。五重殿由几十根巨型石柱支撑，琢磨精雕，柱上斗拱，雕饰，尤以各殿镂空花窗，式样繁多，图案新颖，堪称内地佛教博物馆之冠。