该寺由贡托巴托协于1498年创建，属宁玛派。历史上，这里是各大活佛的修行点，僧人数量最多时为8名。寺庙曾一度损毁，1990年经县政府批准修复开放。寺内主供莲花生佛，还有阿弥陀佛、观世音菩萨和金刚手菩萨等塑像。扎西岛寺周边景观独特，有莲花生合掌石、天生桥、溶洞壁画等自然和人文景观。传说有2800多位高僧在扎西岛修行，增添了浓厚的宗教神秘色彩。每逢羊年转湖时，众多信徒会来到这里朝拜，平时也有不少游客和香客前来参观、祈福。