拉加寺位于青海玛沁县东北部黄河北岸的拉加乡阿尼群贡山下，座东向西，面临黄河，前有1986年建成的黄河大桥可通西岸。这里地处峡谷，海拔低，气候潮湿，沿岸多为良田，自然风光秀丽迷人。