一个不起眼的县级博物馆，除了出土文物，还集中了三峡库区淹没而拆迁集中的古建筑群，有神庙、祠堂、民宅、古桥以及县衙，非常难得，永远保留了三峡库区的历史文化遗迹。

巴东博物馆藏品类别分为传世文物、出土文物和革命文物以及工艺品四大类，其类别有古生物化石、石器、陶瓷器、铜器、铁器、木雕、金银器、玉器、字画、古书、钱币等；藏品有1100件（套），其中珍贵文物405件（套）。