该寺坐落在云南昆明市金碧路西段。据《昆明县志》载，它同南城寺同为元代云南行省平章政事的赛典赤·赡思丁主持肇建。原址在东来街“鱼市”，故又称“东来街清真寺”，元末毁于战火。明永历年间重建，改名为“永宁清真寺”。现存永宁清真寺是清光绪年间所重建。布局为四合院，朝北开有一山字形门楼，门内有轩敞的天井。礼拜殿为歇山顶纯木结构，碧绿色琉璃瓦履盖屋面。殿门正中悬有“朝真殿”木匾。阔4间，深2进，穿斗式梁架。殿内面积约200余平方米。殿前有卷棚式敞廊，两侧墙面绘有麦加朝觐图。殿对面有厢房7间，为参加聚礼者休憩之所。殿侧有教室1座，议事室1厅。浴室设于议事室之后。该寺规模虽小于永历年间所建，但经堂教育一直兴盛，云南各地清真寺的阿訇、掌教多曾在此求学。