博物馆外型设计采用一花五瓣造型，馆内设有花木起源与分类、花木欣赏、花木应用、花木与文化、花木产业的发展及潮流趋势和花木之乡沭阳六个展区，并设有工艺品制作、植物观察、多功能报告厅、动感影院、办公区等功能区，还设有缤纷年华、生命之绿等八个展厅，让参观者总体掌握和了解花木的起源、分类、应用、花木文化以及沭阳花木产业的特色及发展趋势。