阜宁县博物馆整体建筑为仿明清建筑形式，有一个基本成列展、一个明清名人字画展、一个水乡民俗文物展和临时展厅。基本成列展厅，主要用出土文物向观众介绍阜宁的成陆年代和人类在此活动情况。明清名人字画展览，是用博物馆征集的本地明清名人字画，展示阜宁人的文化内涵和人文典故。水乡民俗文物展，是用征集于民间的使用实物，向观众展示具有地方特色的古老民俗和生产、生活习俗。