慈云宫建于清乾隆三十五年，是苗栗后龙镇历史较为悠久的庙宇。寺庙中有许多年代久远的历史文物，包括乾隆时期的古供桌与印有光绪皇帝宫印的“与天同功”匾额，具有历史文化价值。