博物馆建筑按纳西族民居的发展进行布局，利用玉泉水源和象山西麓的自然景观，由北向南开辟了古人类洞穴居、巢居、半穴居、帐篷居、干栏居以及木楞房、三坊一照壁、四台五天井等不同阶段的传统民居，并在其中展出反映各时期纳西族生产力水平的民俗文物资料。开辟“祭天”、祭风”、祭署”等民俗、宗教仪式场景，为观众进行东巴祭祀仪式展演。