威尼斯自然历史博物馆坐落在一栋建于13世纪建造的古建筑中，面朝威尼斯大运河。这里陈列着各种地质时期的化石及很多与自然有关的例如植物、昆虫、动物标本等收藏品。自然历史博物馆内的这些收藏主要来自曾位于此处的科雷尔博物馆（Museo Correr）、威尼托科教文艺中心（Istituto Veneto di Scienze、Lettere e Arti）等等。博物馆会不定期地举办各种自然相关的展览，位于博物馆内的图书馆常年开放，内收藏有超过40,000本自然、历史方面的藏书。