遗址位于古城淮安（今淮安区）市中心的镇淮楼北侧。地上建筑均为复建。 历史上，南粮北调，北盐南运，均途经淮安，使得淮安成为漕运枢纽和指挥中心。明、清时在淮设漕运总督公署，以督查、催促漕运事宜，主管南粮北调等筹运工作。 此处漕运公署，始建于宋乾道六年(1170)，由录事陈敏兴修。经过战争、文革，地上部分基本被毁。2002年，在淮安（楚州）老城围墙巷整治过程中，总督漕运公署遗址被清理出来，改建成遗址公园向市民、游客展示。2002年10月，总督漕运公署遗址被江苏省人民政府公布为第五批省级文物保护单位。2006年5月，被国家文物局公布为大运河江苏淮安段16个重要节点之一。2014年6月22日，作为中国大运河淮安段重要遗产点列入世界文化遗产名录。

位于淮安老城，与淮安府署为邻，目前的地上建筑已经荡然无存，现在做为遗迹公园开放，以前的规模不小，说明历史上这里的重要意义。