建立此类博物馆的想法可以追溯到1928年。但是在当时，这个想法并未受到社会的很大重视。直到20世纪80年代，一位画廊经理在马克西米里安大街开办了一家小型私人博物馆。但10年后，博物馆由于财政原因关闭，展品转到慕尼黑博物馆进行临时展览。2006年时，慕尼黑决定成立一所犹太博物馆，慕尼黑犹太博物馆由此成立。