鳌头古衙门始建于明洪武三十年（1397年）。明朝期间，鳌头属高凉郡茂名县，位于鉴江流域的小东江与袂花江交汇处，沿江商业繁茂，因远离茂名县衙，为加强管理，设鳌头市衙门，管辖沿鉴江流域吴川兰石、浅水、覃巴，化州长岐、电白小良，茂名袂花、镇盛等地的商业和税收。市衙建制沿习至清朝。