芷江博物馆原名“民间石刻木雕艺术博物馆”，纳入芷江文管所发展文博事业规划，为了庆祝中华人民共和国成立40周年，首先开放了以出土文物为主的《芷江县沿革史文物陈列》，遂定名为芷江博物馆。馆址为天后宫始建于清乾隆十三(1748年)，是由客居芷江的福建人集资所建。