东部沙漠紧邻尼罗河三角洲的东南方，向东南延伸至苏丹东北部，又从尼罗河各地向东达苏伊士湾和红海。面积约221,940平方公里。东部沙漠由起伏的沙土高原组成，高原从尼罗河流域起骤然高耸，并在尼罗河以东处并入红海丘陵。