采用“一院六馆”格局，历史馆展示江苏地区历史文化，特展馆常办临时展览，数字馆利用现代技术让观众互动体验，艺术馆展示书画、雕塑等艺术珍品，非遗馆呈现江苏省非物质文化遗产，民国馆则重现民国风情 。

历史底蕴深厚 其前身为1933年蔡元培倡建的国立中央博物院筹备处，见证了中国博物馆事业的发展与近现代文化的变迁，是中国博物馆发展历程的重要参与者. 文物收藏丰富 馆藏各类文物43万余件(套)，涵盖史前至当代的诸多品类，如新石器时代“玉串饰”、东汉“错银铜牛灯”等国宝级文物，数量居中国第二，为研究中国历史文化提供了丰富实物资料. 艺术价值极高 所藏书画、雕刻等艺术品代表着中国顶尖艺术水平，展现了传统艺术魅力，是世界艺术宝库重要组成部分，如“竹林七贤与荣启期”模印砖画等. 教育意义重大 通过展览、讲座等形式普及历史文化知识，是民众学习感受文化的重要平台，还开展社教活动，将教育资源融入社会各界，增强了文化传承的社会基础. 科研实力强劲 作为重要科研基地，拥有专业团队，开展文物保护、修复、研究等工作，其文物保护研究所是纸质文物保护国家文物局重点科研基地，推动了文化遗产保护传承. 文化交流活跃 通过举办国内外展览和交流活动，传播中国优秀文化，吸收借鉴外国文化，促进了文化多元发展，提升了中华文化的国际影响力. 社会价值显著 作为公共文化服务设施和南京文化地标，提升了城市文化品位，推动了文化产业发展，丰富了公众文化生活，增强了公众的文化认同感和民族自豪感. 建筑风格独特 建筑融合传统与现代风格，主殿仿辽代宫殿式建筑，“一院六馆”中的民国馆复原民国街景，让游客有穿越之感，体现了建筑艺术之美.