克孜尔红石林地处拜城盆地与东北部黑英山之间的低山丘陵区，整体地形北高南低，地形由剥蚀、风蚀和流水作用形成的一毓纵横沟谷及沟谷间的梁脊、台地、孤丘等组成。在蜿蜒曲折、大大小小的沟壑中，褐红色、黄绿色、灰绿色的土包层层叠叠，犹如荒废的古罗马城。