小宫博物馆位于宫殿广场北侧，教皇宫对面一座14世纪建筑内，博物馆共有18个展室，以历代教皇私人收藏的祭坛画为主，并收藏了许多阿维尼翁学派以及意大利文艺复兴时期的绘画作品，其中又以圣母与圣婴的收藏最具特色。