三江自然生态馆总占地面积2.7万平方米。其中：一层建筑面积4219平方米，主要展示黑龙江、乌苏里江丰富的淡水鱼资源。二层建筑面积3310平方米，主要设有标本陈列馆和VR体验馆。展厅内部运用声、光、电、影等高科技展览手段，利用空间造型与场景还原方式，全方位展示三江平原湿地及黑土地生态环境、大马哈鱼历险记(VR区)，将观展与体验相结合，使展示内容全面、生动、富有感染力。三层建筑面积2469平方米，设有科普教育馆、非遗展示馆、研学交流区。赫哲族人猎鱼、捕鱼、食鱼为主，主要展示鱼皮制作衣服、挂件等。