原来是明代风格的“五门一照”江南庭院，现在还留存大门、第二中门和照壁。从远处看，照壁白色粉墙、金色的“清真寺”字体、绿色的“麦赛吉德”阿拉伯文字、主体建筑的拱顶绿白相间，在周围一大片现代楼宇中间比较显眼，一眼就能认出。

嘉兴清真古寺原名“真教寺”嘉兴清真古寺分为两院，北侧的照壁屏对着二层的门楼，门楣草书“真教维清”，寺门前立着一对圆形石圭。门楼甬道内，庭院砖石铺地，花坛数台，显得有些逼仄。拱形的月门将南北两院分隔开来，北院有讲经堂，南院有礼拜殿，堂与殿相通，礼拜殿右前建有一碑亭名“清泉亭”。