玛纳斯国家湿地公园位于世界知名的候鸟迁徙3号线上，是候鸟飞越天山的后面一站，也是天山北坡的天然湿地，其生态效应覆盖乌昌城市群和石河子、奎屯、独山子等市区。湿地公园规划范围包括夹河子水库、大海子水库、白土坑水、新户坪水库以及玛纳斯河河道部分区域，规划区面积85平方公里,其中湿地面积68平方公里。被国家列为国家湿地公园。玛纳斯国家湿地公园以水库、鱼塘、沼泽、芦苇滩等水系为主，湿地水域辽阔，池塘众多，滩涂宽阔，植物丛生，有库塘湿地、河流湿地、河谷等地貌景观，湖泊、池塘、河流等水域景观，林木、草地、野生动物及其栖息地等生物景观，芦苇群落、荷花群落等典型的湿地植被景观。湿地生物种类丰富，植物主要有芦苇、柽柳、各种蒿类等盐生植被，柳树、沙枣、胡杨、榆树等林木树；鸟类有短尾信天翁、白腹军舰鸟、黑鹳、中华秋沙鸭、白肩雕、玉带海雕、黑颈鹤等，每年有数千只大天鹅、灰鹤、蓑羽鹤在此越冬。