南京大学地球科学博物馆隶属于南京大学地球科学与工程学院，以反映地质科学史上三大争论：水成论和火成论，固定论和活动论，进化论和突变论之争为指导思想。循此二方面的宗旨决定布展和展品的选择，力求趣味性、新奇性、科学性、自然科学和人文科学的交融。