清净寺整体为 伊斯兰建筑风格，但部分元素也融合了中国传统建筑的特点，主要建筑包括门楼、礼拜堂、明善堂、一处古井，以及多方与寺院历史有关的碑刻。门楼是清净寺的标志性建筑，形式很典型的西亚清真寺风格，尖拱门逐层内凹，第一、二进门道外观均为尖拱形，顶部均为半穹顶，主体风格为伊斯兰穹顶式样，又融合了中国传统建筑中的藻井装饰风格。寺内有多方碑刻，其中《重修清净寺碑记》和《重立清净寺碑》是记录清净寺历史和修缮情况的重要文物。 文化价值

去福建出差，来到了泉州，泉州是一个同时拥有多派别寺庙的城市，来到了清净寺参观，这里是是阿拉伯穆斯林在中国创建的现存最古老的伊斯兰教寺，始建于北宋大中祥符二年。这里仿照叙利亚大马士革伊斯兰教礼拜堂的建筑形式，留存的主要建筑为门楼、礼拜堂、名善堂等部分。