米特拉考古区的主要建筑和遗址包括：宫殿建筑群：米特拉以四方形建筑物和宫殿建筑群为主，墙上有精美的几何图案装饰。这些建筑展示了萨波特克人高超的建筑技艺和艺术才能。墓葬：在南部建筑群中，有两处地下墓葬，这些墓葬是萨波特克人进行祭祀和埋葬贵族的地方。墓葬内部装饰着代表不同含义的“马赛克”图案，这些图案象征着天空、大地、羽蛇神等重要事物。圣巴勃罗教堂：这是一座建于1590年的殖民地风格教堂，它位于米特拉废墟的北建筑群上。这座教堂是利用遗址中的石材在遗址之上就地建造的，它见证了天主教在墨西哥传播的历史以及土著文化被破坏和被动废弃的过程。