万寿塔是南普陀寺的标志性建筑之一，东西两座塔矗立在放生池两侧。塔身通体洁白如玉，纤巧笔直，高耸入云，塔身六面雕刻着不同的佛像，普渡众生。

在南普陀寺里，不需要门票，门口有免费赠香。可以先进去上个香，登南普陀寺的后山，然后在下来逛南普陀寺的万寿塔。万寿塔上有一群成群成群的鸽子。人与动物在这里和平相处，也算是厦门闹市里的一大奇观了。南普陀寺对外人的吸引，大部分时候来自它的素斋。