莎车府景区是清朝对新疆地区治理的重要史证。清朝统一新疆地区后，大体上以1884年新疆建省为界，分为前后两个时期。前期实行军政合一的军府制，乾隆二十七年（1762），清政府设立“总统伊犁等处将军”（伊犁将军）。后期清朝在新疆地区实行行政统一的郡县制，清光绪九年（1883）新疆建省前设莎车直隶州。光绪二十八年（1902），莎车直隶州升为府。