林芝巴结巨柏自然保护区是以保护巨柏林为主的自治区级自然保护区。位于林芝县境内，1985年建。面积8公顷。属高山峡谷地貌，周围高山海拔5000米以上，峡谷海拔3 000米，相对高差约2000米。保护区的建立对于研究当地柏科树木的起源和演化具有十分重要的价值。